Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Itgb5O70309 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Itgb5O70309 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms