Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad51dO55230 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms