Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
OtogO55225 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
OtogO55225 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
OtogO55225 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
OtogO55225 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
OtogO55225 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
OtogO55225 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms