Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atp2a2O55143 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atp2a2O55143 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms