Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eif6O55135 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eif6O55135 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eif6O55135 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms