Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nipsnap2O55126 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nipsnap2O55126 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms