Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nipsnap1O55125 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nipsnap1O55125 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms