Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mmp10O55123 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mmp10O55123 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mmp10O55123 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mmp10O55123 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mmp10O55123 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mmp10O55123 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms