Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SncaO55042 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SncaO55042 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SncaO55042 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SncaO55042 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SncaO55042 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms