Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc3O55013 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms