Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LatO54957 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LatO54957 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LatO54957 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LatO54957 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LatO54957 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LatO54957 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LatO54957 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LatO54957 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LatO54957 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LatO54957 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LatO54957 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms