Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TsksO54887 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TsksO54887 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TsksO54887 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TsksO54887 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TsksO54887 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TsksO54887 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TsksO54887 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TsksO54887 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TsksO54887 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TsksO54887 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TsksO54887 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TsksO54887 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TsksO54887 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TsksO54887 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TsksO54887 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TsksO54887 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TsksO54887 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TsksO54887 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms