Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tnfrsf18O35714 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tnfrsf18O35714 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms