Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Notch2O35516 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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