Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Clk2O35491 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Clk2O35491 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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