Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ppt2O35448 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ppt2O35448 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms