Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KeraO35367 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KeraO35367 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KeraO35367 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KeraO35367 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KeraO35367 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KeraO35367 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KeraO35367 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KeraO35367 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KeraO35367 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KeraO35367 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KeraO35367 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KeraO35367 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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