Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Kpna3O35344 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kpna3O35344 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kpna3O35344 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms