Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sh2d1bO35324 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sh2d1bO35324 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms