Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smad6O35182 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smad6O35182 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smad6O35182 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms