Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Nedd9O35177 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Nedd9O35177 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nedd9O35177 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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