Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scarb2O35114 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scarb2O35114 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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