Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
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Cldn4O35054 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Cldn4O35054 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn4O35054 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms