Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha8O09127 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha8O09127 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Epha8O09127 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Epha8O09127 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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