Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CckarO08786 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CckarO08786 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CckarO08786 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CckarO08786 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CckarO08786 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CckarO08786 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CckarO08786 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms