Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rundc3aO08576 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rundc3aO08576 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms