Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3488M0QW81 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3488M0QW81 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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