Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm2035J3QP87 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2035J3QP87 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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