Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp616J3QN14 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp616J3QN14 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms