Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM6

Gm21746, Predicted gene, 21746, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21746J3QMM6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21746J3QMM6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms