Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn34c3J3QJW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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Cldn34c3J3QJW5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Cldn34c3J3QJW5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cldn34c3J3QJW5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn34c3J3QJW5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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