Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pot1bH7BX60 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pot1bH7BX60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms