Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r67G5E8C1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r67G5E8C1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms