Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b1G5E829 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atp2b1G5E829 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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