Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcf11G3X9Z4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pcf11G3X9Z4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcf11G3X9Z4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms