Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfgef1G3X9K3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfgef1G3X9K3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfgef1G3X9K3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms