Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sh3tc1G3X9F6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3tc1G3X9F6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms