Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn2r85G3UW56 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn2r85G3UW56 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms