Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cldn34aG3UW52 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cldn34aG3UW52 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms