Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl26F8VQM2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl26F8VQM2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl26F8VQM2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl26F8VQM2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl26F8VQM2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms