Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NpcdF8VQB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NpcdF8VQB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms