Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LctF8VPT3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LctF8VPT3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LctF8VPT3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms