Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
3110082J24RikF6Z6Z2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
3110082J24RikF6Z6Z2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms