Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6482F6YHC1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm6482F6YHC1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms