Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm10378F6XQQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm10378F6XQQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms