Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm5861F6VCN9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm5861F6VCN9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms