Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptbn5F6UCX4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sptbn5F6UCX4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms