Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Syngap1F6SEU4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syngap1F6SEU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syngap1F6SEU4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms