Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prl3d2F6R3P9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prl3d2F6R3P9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prl3d2F6R3P9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms