Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp17lbE9Q9U0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp17lbE9Q9U0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms